فاضلاب بیمارستان دارای مواد و ترکیبات سمی و عفونی است که برای سلامت کارکنان ، محیط بهداشت و درمان و جامعه مضر است، از این رو پروسه تصفیه فاضلاب بیمارستان بسیار حساس و مهم است.
از بزرگترین نگرانی ها برای فاضلاب بیمارستان، وجود عوامل بیماری زا در انواع ویروس، باکتری و انگل روده ای است. این عوامل بیماری زا به راحتی از طریق آب به همه جا انتقال پیدا می کند. نکته مهم دیگر مقاومت دارویی بالای برخی عوامل بیماری زا در فاضلاب بیمارستان است که یک تهدید جدی روی سلامت جامعه به حساب می آید. از طرف دیگر مقداری از زایدات دارویی شامل آنتی بیوتیک ها و داروهای ژنوتوکسیک هم توسط قسمت های گوناگون در بیمارستان و داروخانه ها وارد شبکه جمع آوری فاضلاب بیمارستان می شوند.
اگر بخواهیم به فاضلاب بیمارستان کلر یا مواد اکسید کننده اضافه کنیم تا آلودگی مواد آلی از بین رود، باعث ایجاد خطرات ثانویه می شود. برای مثال باعث می شود این مواد با ترکیبات هالوژن واکنش اکسیداسیون داده و ترکیبات هالوژن آلی را به وجود آورند که این مواد بسیار مقاوم بوده و تجزیه پذیری کمی دارند.
ترمیکا در تصفیه فاضلاب بیمارستانی به مراتب بهتر از کلر عمل می کند، زیرا خاصیت گند زدایی این محصول بیشتر از هیپو کلروس و کلر است و از طرف دیگر این اسید بوی فاضلاب را کاهش داده و درجه ی کدری فاضلاب را از بین می برد و در نهایت پس از انجام ضدعفونی و گندزدایی آب و فاضلاب به آب و دی اکسید کربن تبدیل می شود در نتیجه آبی که پس از تصفیه در مصارف صنعتی ، کشاورزی و حتی شستشو به کار میرود فاقد مضرات ناشی از استفاده از کلر می باشد.